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CircRNA測序
產品簡介

           circRNA 是最近發現的一類特殊的 lncRNA,廣泛存在于動物和植物中的。circRNA 表達具有組織特異性;其獨特的環狀結構使其能夠逃逸 RNAse 酶的降解,具有很強的胞內穩定性,能夠長效行使轉錄“調控者”的職能。circRNA 在生物的發育及分化過程中,起重要調控作用。

技術流程



樣品要求

1)樣品類型:純凈細胞系、組織、去蛋白并進行DNase處理后的完整總RNA;
 
2)樣品需求量:(去除rRNA、去除線性RNA)的鏈特異性文庫:樣品Total RNA≥20 μg;
 
3)樣品濃度:(去除rRNA、去除線性RNA)的鏈特異性文庫:≥200 ng/μl;
 
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.2,OD260/230≥2.0,樣品RIN ≥ 7.0,28S:18S≥1.0。

案例解析
       
環狀RNA最早發現于20世紀初期,但人們對其功能知之甚少,也沒有研究它
的有效方法,隨著高通量測序技術的發展,推動了環狀RNA的研究,發現環狀RNA并非是基因組內的“暗物質”,而是執行多種功能,如可以調控小RNA,影響轉錄組調控,該文獻是不可多得的有關環狀RNA的論述。原文快速閱讀:http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n5/abs/nbt.2890.html





參考文獻
    Jeck WR,   Sharpless NE:   Detecting and characterizing circular RNAs. Nature biotechnology 2014, 32(5):453-461. 
 
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